經過近30年的實踐和發展，我國專利行政執法工作取得了長足的進步，通過積極開展集中檢查、集中整治、集中辦案活動，不斷加大執法辦案力度，深入開展“護航”專項行動，大力打擊涉及民生、重大項目等領域的專利侵權假冒行為，快速調處專利糾紛，積極維護權利人、市場主體和創新主體的合法權益，為營造公平有序的市場環境發揮了重要作用。以2013年度為例，全系統執法辦案總量達1.6227萬件，同比增長79.8%，其中包括專利糾紛案5056件，同比增長101.4%。實踐證明，專利行政執法途徑符合我國國情，是滿足我國當前現實需求的必然選擇。
加強專利行政執法，是維護市場公平競爭環境的客觀需要。盡管我國專利行政執法取得一些成績，但由于我國建立知識產權制度的時間不長，社會公眾的知識產權意識還不高，市場經濟秩序還不很規范，一些地區和領域侵權假冒現象影響惡劣，維權成本高、侵權成本低現象還比較嚴重，尤其是群體侵權、反復侵權、惡意侵權問題十分突出。這些情況不僅嚴重損害了權利人的利益，而且也擾亂了正常的社會秩序，侵害了國家和社會公眾的利益。
面對這種情況，僅僅采用“坐堂問案”的司法保護方式，往往難以達到理想的效果，同時也使專利權人在時間、成本等方面承擔過重的訴訟負擔。目前，我國社會公眾對專利行政執法工作的認可度不斷提高，根據2013年的調查結果，當專利權人面對侵權行為時，選擇行政途徑的占43.4%，協商解決占39.5%，司法途徑占16.3%。通過選擇行政途徑解決專利侵權糾紛，專利管理部門可以發揮主動、簡便、快捷的優勢，有效保護專利權人和社會公眾的合法權益。同時，專利管理部門可采取跨區域、跨部門執法協作模式，或采取省、市、縣上下聯動執法模式，效果顯著。
加強專利行政執法，是保障專利制度健康有序運行的客觀需要。專利制度的直接功能，是國家通過承諾對專利權進行有效保護來換取專利信息的公開。對依法審批授予的專利權，政府應當承擔一定的保護職責。這關系到政府的公信力，也是保障專利制度有效運行的基本需要。
同時，相比于有形財產，專利權作為一種法律創設的權利，具有公開性、無形性、可復制性的特點，侵權證據難以收集，權利極易受到侵害。從這個意義上講，相比有形財產權，專利權對行政保護有著更大的需求。
近年來，隨著信息技術的快速發展，知識產權信息的傳播越來越快捷、廣泛，侵權假冒產品的制造水平越來越高、擴散速度越來越快，權利人本人有時很難發現自己的權利被侵犯。調查反映，30%的專利權人遭遇過侵權糾紛，但其中僅10%的權利人采取了維權措施，很多權利人因為專利權難以得到保護已經喪失了對專利制度的信心。在這種情況下，僅靠不告不理的司法方式無法有效保護權利人的合法權益；而專利行政執法可以主動查處，優勢明顯，是保障專利制度健康有序運行的重要手段。
加強專利行政執法，是促進經濟轉型升級、轉變政府職能的客觀需要。當前，世界正孕育著新一輪的科技創新競爭高潮，提高創新能力對于提升綜合國力的決定性意義更加突出。黨的十八大報告提出“實施知識產權戰略，加強知識產權保護”，十八屆三中全會明確要求“加強知識產權運用和保護”“加強市場監管”，中央經濟工作會議強調“政府要做好加強知識產權保護”工作。我國加速創新發展步伐，必須充分發揮專利制度引領和支撐創新的功能，全面提高專利制度保護創新的效率，積極搶占全球科技創新和戰略性新興產業發展的制高點，同時，促進我國經濟發展盡快走上“創新驅動、內生增長”的軌道。保護專利權，就是保護技術創新，就是保護先進生產力。只有專利行政執法到位了，專利權人的創新活力才能充分激發，才能促進創新與發展，形成保護、創新、發展的良性循環，切實激勵發明創造，提升科技創新的效率，促進我國經濟由要素驅動向創新驅動轉變，實現經濟提質增效升級。
市場經濟條件下，政府將不再直接控制企業、項目，而是通過加強事中、事后監管來提供良好的社會環境、市場環境，遵循的原則是依法行政。依法行政具體體現在兩個方面，一是抽象的行政行為，即制定規章制度與政策，并盡可能使政策規范化制度化；二是行政執法，即具體的行政行為，包括依法裁決相對人之間的爭端，迅速化解各類社會矛盾，查處違法行為，保護守法者的正當利益，維護和諧穩定的社會秩序與誠信的市場秩序。隨著我國創新能力不斷增強、專利授權量日益增多，專利侵權糾紛也在逐年增加，正如交通糾紛隨著車輛大幅增加而逐年增多一樣，同樣，專利管理部門也應該像交通管理部門積極維護正常交通秩序一樣，積極承擔起維護專利制度有效運行的職責。所以，從長遠來看，加強專利行政執法是完善社會主義市場經濟體制、規范市場秩序和建立誠信社會的需要。
總之，是否能夠有效保護專利權，對確保專利制度的有效運行、提高創新能力和核心競爭力、促進經濟轉型升級與經濟社會發展，起著至關重要的作用。因此，專利制度的設計與完善要充分考慮我國當前現實國情和專利保護的實際狀況，有必要加快修改相關法律，為增加專利行政執法權限和手段、強化專利侵權救濟、遏制侵權提供充分依據，保障其立法本意的實現。
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